В целях расширения производства и увеличения поголовья лошадей в 2009 году был создан филиал в Мишкинском районе, д. Ишимово, Данный филиал создан, главным образом, для ведения табунного коневодства.
В своей деятельности регулярно сотрудничаем с Всероссийским НИИ коневодства в г. Рязани по идентификации и паспортизации племенного молодняка лошадей коневладедьцев. Совместно с племотделом МСХ РБ и БашНИИСХ подготовлен и утвержден Министром сельского хозяйства РБ положение о паспортизации лошадей башкирской породы. Разработана и утверждена форма паспорта племенной лошади башкирской породы. Создана экспертная комиссия по идентификации башкирской породы лошадей. Кроме того, ГБУ РБ ГЗК «Уфимская» занимается научно-исследовательской работой. В хозяйствах республики внедряются новые прогрессивные технологии – в ряде хозяйств, впервые, проводили чипирование лошадей на договорной основе. Ведётся работа по составлению селекционного плана в этих хозяйствах, разработка которых приведёт к улучшению качеств пород племенных лошадей. Созданы племенные репродукторы.